準(zhǔn)備工作
設(shè)備校準(zhǔn):在開(kāi)始測(cè)序之前,需要對(duì)基因測(cè)序儀進(jìn)行校準(zhǔn),確保其性能符合標(biāo)準(zhǔn)。
樣本準(zhǔn)備:
DNA提?。簭纳飿颖荆ㄈ缪?、組織等)中提?。模危?。
文庫(kù)構(gòu)建:將提取的DNA打斷成小片段,然后進(jìn)行末端修復(fù)、加A尾、接頭連接等步驟,構(gòu)建成適合測(cè)序的文庫(kù)。
樣本質(zhì)量控制:對(duì)構(gòu)建好的文庫(kù)進(jìn)行定量和質(zhì)控,確保文庫(kù)的質(zhì)量。
測(cè)序步驟
上機(jī)測(cè)序:
將合格的文庫(kù)樣本添加到測(cè)序反應(yīng)體系中。
將反應(yīng)體系加載到測(cè)序儀的樣本板(或芯片)上。
測(cè)序反應(yīng):
PCR擴(kuò)增:對(duì)文庫(kù)樣本進(jìn)行PCR擴(kuò)增,以增加目標(biāo)區(qū)域的DNA量。
測(cè)序:測(cè)序儀會(huì)逐個(gè)讀?。模危疗蔚男蛄行畔?。
測(cè)序儀會(huì)按照預(yù)定的測(cè)序流程進(jìn)行反應(yīng),通常包括以下步驟:
數(shù)據(jù)收集:
測(cè)序儀會(huì)將測(cè)序結(jié)果以圖像或數(shù)據(jù)流的形式輸出。
數(shù)據(jù)分析:
質(zhì)量控制:去除低質(zhì)量序列。
序列拼接:將測(cè)序得到的短讀段拼接成長(zhǎng)序列。
比對(duì):將拼接后的序列與參考基因組比對(duì),確定變異位點(diǎn)。
變異注釋:對(duì)檢測(cè)到的變異進(jìn)行功能注釋。
將測(cè)序數(shù)據(jù)導(dǎo)入生物信息學(xué)軟件進(jìn)行分析,包括:
后續(xù)操作
結(jié)果解讀:根據(jù)數(shù)據(jù)分析結(jié)果,解讀測(cè)序數(shù)據(jù),得出生物學(xué)結(jié)論。
報(bào)告生成:將分析結(jié)果整理成報(bào)告,供**或研究使用。
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